RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	CTGF	P29279	349 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PSMC4	P43686	418 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SOX10	P56693	466 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	TREML2	Q5T2D2	321 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GPATCH3	Q96I76	525 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		13.88	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SHMT1	P34896	483 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PLCD1	P51178	756 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	HMGCS2	P54868	508 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	LCORL	Q8N3X6	602 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ZNF333	Q96JL9	665 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		13.87	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MYH7	P12883	1935 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GDF11	O95390	407 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	OSBP	P22059	807 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MTMR2	Q13614	643 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	C12orf42	Q96LP6	360 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ARMT1	Q9H993	441 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MBD4	O95243	580 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GH2	P01242	217 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	FCGRT	P55899	365 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	BCL11A	Q9H165	835 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		13.85	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	GCC1	Q96CN9	775 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MGAM	O43451	1857 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		13.84	□□□□□ -0.19
CS-223	ENST00000551137	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ERC2	O15083	957 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	PRKAB2	O43741	272 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP14	P54578	494 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	IRF5	Q13568	498 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.83	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	BRCA2	P51587	3418 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CHGB	P05060	677 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	APPBP2	Q92624	585 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.82	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L12	C9JPN9	530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	USP17L21	D6R901	530 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	MX1	P20591	662 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	GRK4	P32298	578 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	HERVK_113	P62684	666 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	EVX2	Q03828	476 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	SBK1	Q52WX2	424 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	LBX2	Q6XYB7	198 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	TICAM2	Q86XR7	235 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	RAET1E	Q8TD07	263 aa		13.81	□□□□□ -0.2
CS-223	ENST00000551137	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.81	□□□□□ -0.2

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