RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 BRAPQ7Z569 592 aa23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ERICH2A1L162 156 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L3A6NCW0 530 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L4A6NCW7 530 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 PRDM1O75626 825 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 C12orf60Q5U649 245 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TEX11Q8IYF3 940 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 TMTC2Q8N394 836 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CLSTN2Q9H4D0 955 aa23.53■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 RXRAP19793 462 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC27P30260 824 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CAMK4Q16566 473 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 NR1I2O75469 434 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 CERS3Q8IU89 383 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.52■■□□□ 1.36
PACSIN3-211ENST00000539589 WTAPQ15007 396 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ALG1Q9BT22 464 aa23.51■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCG2P16885 1265 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 FLT1P17948 1338 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 PLCD1P51178 756 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 NTRK3Q16288 839 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ESR2Q92731 530 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.5■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ORC4O43929 436 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN1P35523 988 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 MYL10Q9BUA6 226 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 NID2Q14112 1375 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CRKP46108 304 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ME1P48163 572 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 PHKBQ93100 1093 aa23.49■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 UTRNP46939 3433 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 RCAN1P53805 252 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 SEC23AQ15436 765 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 TEKT1Q969V4 418 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 GJB4Q9NTQ9 266 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 STK36Q9NRP7 1315 aa23.48■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 SOGA3Q5TF21 947 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 TYRO3Q06418 890 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 TRIM29Q14134 588 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CKAP2LQ8IYA6 745 aa23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 YEATS4O95619 227 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 IFNAR1P17181 557 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 RTN1Q16799 776 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 WASF1Q92558 559 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 MRIQ9BWK5 157 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 USP40Q9NVE5 1235 aa23.46■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 STK38Q15208 465 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 KRT40Q6A162 431 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 AIFM3Q96NN9 605 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 TNKSO95271 1327 aa23.45■■□□□ 1.35
PACSIN3-211ENST00000539589 KIF28PB7ZC32 967 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 CTAGE5O15320 804 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ADALQ6DHV7 355 aa23.45■■□□□ 1.34
PACSIN3-211ENST00000539589 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
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