RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 FBXL16Q8N461 479 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC18Q9H819 358 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.1□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 AK2P54819 239 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TFAP4Q01664 338 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 MAP3K10Q02779 954 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZUG5 572 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
LMO3-218ENST00000538020 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CHST3Q7LGC8 479 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 LDHDQ86WU2 507 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TMTC2Q8N394 836 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TNKSO95271 1327 aa14.08□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 FAM196BA6NMK8 535 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ADM5C9JUS6 153 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NF2P35240 595 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 LIFRP42702 1097 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 WTAPQ15007 396 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZNF341Q9BYN7 854 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CABP5Q9NP86 173 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NMRK2Q9NPI5 230 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.07□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 AKR1B1P15121 316 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 MIGA2Q7L4E1 593 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 USP48Q86UV5 1035 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 BRF1Q92994 677 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 LY9Q9HBG7 655 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GINM1Q9NU53 330 aa14.06□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CCDC69A6NI79 296 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SEC23AQ15436 765 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 DGKHQ86XP1 1220 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CDCA5Q96FF9 252 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D2Q9BYX2 928 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SSC5DA1L4H1 1573 aa14.05□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GDF11O95390 407 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ASNSP08243 561 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 POTEIP0CG38 1075 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 POTEJP0CG39 1038 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 SLURP2P0DP57 97 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CAP2P40123 477 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 APOBRQ0VD83 1088 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ANKS1AQ92625 1134 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 NMT2O60551 498 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TTLL1O95922 423 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 GH2P01242 217 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 RCAN1P53805 252 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 EVCP57679 992 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 CEP95Q96GE4 821 aa14.03□□□□□ -0.16
LMO3-218ENST00000538020 TMX3Q96JJ7 454 aa14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms