RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.36■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L10C9JJH3 530 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GDF11O95390 407 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OSBPP22059 807 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.35■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.34■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.34■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTMR2Q13614 643 aa20.33■□□□□ 0.85
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.33■□□□□ 0.85
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABPAQ06546 454 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCORLQ8N3X6 602 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.32■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPATCH3Q96I76 525 aa20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.32■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARMT1Q9H993 441 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CABP5Q9NP86 173 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.31■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SHMT1P34896 483 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.3■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MBD4O95243 580 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRK4P32298 578 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRKCZQ05513 592 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.29■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.28■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf42Q96LP6 360 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.28■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IRF5Q13568 498 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GABRQQ9UN88 632 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC41PQ6P2S7 1318 aa20.27■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FLT3LGP49771 235 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AAMPQ13685 434 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERC2O15083 957 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHGBP05060 677 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GUCY1A2P33402 732 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HERVK_113P62684 666 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBXN2AP68543 259 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C12orf60Q5U649 245 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CRBNQ96SW2 442 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FEZ1Q99689 392 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L15C9J2P7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L12C9JPN9 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L11C9JVI0 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L21D6R901 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L18D6R9N7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L22D6RA61 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L19D6RCP7 530 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 USP17L20D6RJB6 530 aa20.24■□□□□ 0.83
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