RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 PI16Q6UXB8 463 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 TMC7Q7Z402 723 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 ABCB6Q9NP58 842 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 ADAMTS20P59510 1910 aa5.17□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 CEP164Q9UPV0 1460 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 BRD1O95696 1058 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 RAC2P15153 192 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 EFEMP1Q12805 493 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 GRM2Q14416 872 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC120Q96HB5 630 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 DMRTB1Q96MA1 342 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 KCTD3Q9Y597 815 aa5.16□□□□□ -1.58
ATXN3-211ENST00000511362 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SLFN14P0C7P3 912 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 FAAP100Q0VG06 881 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF385BQ569K4 471 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MCOLN1Q9GZU1 580 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MYRFQ9Y2G1 1151 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SMARCA4P51532 1647 aa5.15□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 NEFMP07197 916 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ISL2Q96A47 359 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 DCTN4Q9UJW0 460 aa5.14□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF862O60290 1169 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MAPK1P28482 360 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 FCGRTP55899 365 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PLCB3Q01970 1234 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 DSC3Q14574 896 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TTC6Q86TZ1 520 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MYLIPQ8WY64 445 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TRAK1Q9UPV9 953 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 CHD1O14646 1710 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 RFXAPO00287 272 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ERVFC1P60507 584 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 AP3B2Q13367 1082 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 NXPE4Q6UWF7 544 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 BCO2Q9BYV7 579 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 NLRP2Q9NX02 1062 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SLAMF8Q9P0V8 285 aa5.12□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TREHO43280 583 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SEMA7AO75326 666 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SETDB2Q96T68 719 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PRDM10Q9NQV6 1147 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 CADPSQ9ULU8 1353 aa5.11□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZXDAP98168 799 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 SSPNQ14714 243 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 STK35Q8TDR2 534 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 GPR20Q99678 358 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 GCM1Q9NP62 436 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.1□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PEX10O60683 326 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 MAPK8P45983 427 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 PLP2Q04941 152 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF605Q86T29 641 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TEPSINQ96N21 525 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 FOXQ1Q9C009 403 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 RNF32Q9H0A6 362 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.09□□□□□ -1.59
ATXN3-211ENST00000511362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 HPXP02790 462 aa5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 HK2P52789 917 aa5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.08□□□□□ -1.6
ATXN3-211ENST00000511362 PDZD3Q86UT5 571 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms