RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510829.6

RABGEF1-208, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-208ENST00000510829 TFAP4Q01664 338 aa12.69□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 CEP131Q9UPN4 1083 aa12.69□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 ADRA2BP18089 450 aa12.68□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 PYCARDQ9ULZ3 195 aa12.68□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 NLRP12P59046 1061 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 LRMPQ12912 555 aa12.67□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 SMTNL1A8MU46 457 aa12.67□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 CCDC34Q96HJ3 373 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 MAP3K14Q99558 947 aa12.67□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
RABGEF1-208ENST00000510829 KRT27Q7Z3Y8 459 aa12.66□□□□□ -0.38
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RABGEF1-208ENST00000510829 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L3A6NCW0 530 aa12.64□□□□□ -0.39
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RABGEF1-208ENST00000510829 USP17L1Q7RTZ2 530 aa12.64□□□□□ -0.39
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RABGEF1-208ENST00000510829 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.64□□□□□ -0.39
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