RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 FOXQ1Q9C009 403 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 SEPT6Q14141 434 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 OGFOD2Q6N063 350 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 HID1Q8IV36 788 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 ITIH2P19823 946 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD2AQ8NA29 543 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 RIN3Q8TB24 985 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 SMARCA4P51532 1647 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 BIN1O00499 593 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PSMD2Q13200 908 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PHC3Q8NDX5 983 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PI4K2BQ8TCG2 481 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 FAM161BQ96MY7 647 aa8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PDE4D-217ENST00000509355 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 PRR33A8MZF0 331 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RLBP1P12271 317 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 GRK4P32298 578 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 CLCN7P51798 805 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ETF1P62495 437 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 MAP3K11Q16584 847 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.33□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ASB11Q8WXH4 323 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 MIPEPQ99797 713 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ST14Q9Y5Y6 855 aa8.31□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 FAM221AA4D161 298 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ERCC3P19447 782 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 FZD5Q13467 585 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 CRELD1Q96HD1 420 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa8.3□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 CILPO75339 1184 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 SLC6A19Q695T7 634 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RHOVQ96L33 236 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 LMCD1Q9NZU5 365 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.29□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 LMNB2Q03252 620 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM87BQ96K49 555 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 HSPA12BQ96MM6 686 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.28□□□□□ -1.08
PDE4D-217ENST00000509355 ARAP1Q96P48 1450 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 SORBS3O60504 671 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PGRP06401 933 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 C8AP07357 584 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 LMNB1P20700 586 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 MFSD4AQ8N468 514 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.27□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 ZP2Q05996 745 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 IKZF1Q13422 519 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC27Q2M243 656 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM201Q5SNT2 666 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.26□□□□□ -1.09
PDE4D-217ENST00000509355 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
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