RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 ALDH1L1O75891 902 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PGRP06401 933 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ARAFP10398 606 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 BMP4P12644 408 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SDSP20132 328 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 MAOBP27338 520 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GRK4P32298 578 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CCNFP41002 786 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PDE4BQ07343 736 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SV2CQ496J9 727 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PMM1Q92871 262 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CDC6Q99741 560 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RUSC1Q9BVN2 902 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FAM83GA6ND36 823 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 AGRPO00253 132 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CYP11A1P05108 521 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RAG1P15918 1043 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LIG1P18858 919 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PDE3AQ14432 1141 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GRIK5Q16478 980 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GORABQ5T7V8 394 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 C12orf40Q86WS4 652 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CSADQ9Y600 493 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ST8SIA5O15466 376 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 BAG6P46379 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GUCY2FP51841 1108 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PIP4K2BP78356 416 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LRRC41Q15345 812 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 FCHSD1Q86WN1 690 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TMEM192Q8IY95 271 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ATL2Q8NHH9 583 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 NUDT8Q8WV74 236 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TTC9Q92623 222 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CCDC136Q96JN2 1154 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SLC6A18Q96N87 628 aa6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LGR4Q9BXB1 951 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 DACH1Q9UI36 760 aa6.69□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 KATNA1O75449 491 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 DGAT1O75907 488 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 EYA4O95677 639 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 EPHB1P54762 984 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 PPP2R2AP63151 447 aa6.68□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 PKDCCQ504Y2 493 aa6.68□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 FAM13CQ8NE31 585 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RIN3Q8TB24 985 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 MORC4Q8TE76 937 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa6.68□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.68□□□□□ -1.34
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HERC3-209ENST00000504994 C9IYK1 514 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 TP53P04637 393 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ITGAVP06756 1048 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 EPHX1P07099 455 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 RING1Q06587 406 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 MCL1Q07820 350 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 HAUS7Q99871 368 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 OSGEPQ9NPF4 335 aa6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HERC3-209ENST00000504994 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
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