RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 OSBP2Q969R2 916 aa23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 CABP5Q9NP86 173 aa23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GNAT2P19087 354 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SP3Q02447 781 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ERO1AQ96HE7 468 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L12C9JPN9 530 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L21D6R901 530 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GPAA1O43292 621 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TLR2O60603 784 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP2D6P10635 497 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MOGSQ13724 837 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 WDR18Q9BV38 432 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PTPRFP10586 1907 aa23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GH2P01242 217 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 APPP05067 770 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GABPAQ06546 454 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SWAP70Q9UH65 585 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 M0R2C6 588 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SHMT1P34896 483 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 JAG1P78504 1218 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF6Q15052 776 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 C12orf60Q5U649 245 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 RILPL2Q969X0 211 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 C19orf81C9J6K1 198 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L10C9JJH3 530 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 HMGCS2P54868 508 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CTR9Q6PD62 1173 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD8Q96I13 439 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH8P13535 1937 aa23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP4-209ENST00000484097 CAPN15O75808 1086 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 BACE1P56817 501 aa23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP4-209ENST00000484097 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
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SH3BP4-209ENST00000484097 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.08■■□□□ 1.29
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SH3BP4-209ENST00000484097 MTMR2Q13614 643 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TICAM2Q86XR7 235 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 CPA4Q9UI42 421 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 PNMA3Q9UL41 463 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM17Q9Y577 477 aa23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4-209ENST00000484097 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 CYP2C8P10632 490 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 OSBPP22059 807 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK8P49336 464 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 SBK1Q52WX2 424 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 FEZ1Q99689 392 aa23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 C17orf99Q6UX52 265 aa23.06■■□□□ 1.28
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SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC17Q96LX7 622 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 EFCC1Q9HA90 598 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 TREML2Q5T2D2 321 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 USP14P54578 494 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 SEPT2Q15019 361 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 NAPBQ9H115 298 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4-209ENST00000484097 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.03■■□□□ 1.28
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