RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482928.5

TSPAN1-208, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN1, Length 844 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-208ENST00000482928 C12orf60Q5U649 245 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN1-208ENST00000482928 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN1-208ENST00000482928 IQCA1Q86XH1 822 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN1-208ENST00000482928 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TSPAN1-208ENST00000482928 COL4A5P29400 1685 aa14.65□□□□□ -0.06
TSPAN1-208ENST00000482928 CCDC69A6NI79 296 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CYP2D6P10635 497 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 STK3Q13188 491 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 HHIPL1Q96JK4 782 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TSPY2A6NKD2 308 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TRAF5O00463 557 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ORC4O43929 436 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 APOBRQ0VD83 1088 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CUL4AQ13619 759 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 WTAPQ15007 396 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TMTC2Q8N394 836 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZIC5Q96T25 663 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 MTA3Q9BTC8 594 aa14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 PRDM1O75626 825 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ME3Q16798 604 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 FBXL16Q8N461 479 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 FAM122AQ96E09 287 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 OTUD5Q96G74 571 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 GMLQ99445 158 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 INCENPQ9NQS7 918 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 MYH1P12882 1939 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 FOCADQ5VW36 1801 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.62□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SPDYE2BA6NHP3 402 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 FZD9O00144 591 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TRPA1O75762 1119 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SPDYE6P0CI01 402 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ANTXR2P58335 489 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TCP10Q12799 353 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 NECAB1Q8N987 351 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SWAP70Q9UH65 585 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 SLC12A7Q9Y666 1083 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.61□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CPLX1O14810 134 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 LARGE1O95461 756 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TSPY3P0CV98 308 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TSPY8P0CW00 308 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 TNNI2P48788 182 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 PLCD1P51178 756 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 IDI2Q9BXS1 227 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 VEZTQ9HBM0 779 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 KIF3AQ9Y496 699 aa14.6□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CLRN2A0PK11 232 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 H7C1D1 291 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ZBTB43O43298 467 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 PFKFB2O60825 505 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 ENTPD3O75355 529 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 FGRP09769 529 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 LIFRP42702 1097 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CDK8P49336 464 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 CACNB3P54284 484 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 NUCB2P80303 420 aa14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TSPAN1-208ENST00000482928 C16orf86Q6ZW13 317 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms