RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 FCGRTP55899 365 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 BACE1P56817 501 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 TTC6Q86TZ1 520 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 LCORLQ8N3X6 602 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 PNMA3Q9UL41 463 aa22.75■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 GH2P01242 217 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 CHGBP05060 677 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 EHD4Q9H223 541 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 GINM1Q9NU53 330 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 MYPNQ86TC9 1320 aa22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ADD2P35612 726 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 EVX2Q03828 476 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 PRKCZQ05513 592 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 RAET1EQ8TD07 263 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ARMT1Q9H993 441 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.73■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 USP17L10C9JJH3 530 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 GABRQQ9UN88 632 aa22.72■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 C19orf81C9J6K1 198 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 MBD4O95243 580 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.71■■□□□ 1.23
UPP1-211ENST00000482015 PRKAB2O43741 272 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 SHMT1P34896 483 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 MYH1P12882 1939 aa22.7■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 CYP2D6P10635 497 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 GRK4P32298 578 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 MTFR1Q15390 333 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.69■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 FLT3LGP49771 235 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 GABPAQ06546 454 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 UBE3CQ15386 1083 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 BRCA2P51587 3418 aa22.68■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 CABP5Q9NP86 173 aa22.67■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 PEX10O60683 326 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 CRBNQ96SW2 442 aa22.66■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 GUCY1A2P33402 732 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 ACER1Q8TDN7 264 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 COA7Q96BR5 231 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 GPATCH3Q96I76 525 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 FEZ1Q99689 392 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.65■■□□□ 1.22
UPP1-211ENST00000482015 SMIM22K7EJ46 135 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 ADCY3O60266 1144 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 ELNP15502 786 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 HERVK_113P62684 666 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 SEPT2Q15019 361 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.64■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 MGAMO43451 1857 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L12C9JPN9 530 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L21D6R901 530 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 CCL5P13501 91 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP14P54578 494 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 UBXN2AP68543 259 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms