RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.97■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 CYP2D6P10635 497 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 EVX2Q03828 476 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 MOGSQ13724 837 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 FKTNO75072 461 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GNAT2P19087 354 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 JAG1P78504 1218 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GABPAQ06546 454 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NELFE-208ENST00000481121 SHMT1P34896 483 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 SPP2Q13103 211 aa24.95■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 USP17L12C9JPN9 530 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 USP17L21D6R901 530 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 PDHXO00330 501 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 GH2P01242 217 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 C12orf60Q5U649 245 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 SWAP70Q9UH65 585 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.94■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 RILPL2Q969X0 211 aa24.93■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 DGKZQ13574 1117 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 ABCB5Q2M3G0 1257 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 WDR18Q9BV38 432 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.92■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 APPP05067 770 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 TDO2P48775 406 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 CTR9Q6PD62 1173 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 TICAM2Q86XR7 235 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 CABP5Q9NP86 173 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 TLR2O60603 784 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 HMGCS2P54868 508 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 MTMR2Q13614 643 aa24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 MGAMO43451 1857 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 PDE4AP27815 886 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.9■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
NELFE-208ENST00000481121 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SP3Q02447 781 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SBK1Q52WX2 424 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 ERO1AQ96HE7 468 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 MCOLN1Q9GZU1 580 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.89■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SMIM22K7EJ46 135 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 BACE1P56817 501 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.88■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 USP17L10C9JJH3 530 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 TREML2Q5T2D2 321 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 FEZ1Q99689 392 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.87■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 A0A0D9SFI3 127 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CYP2C8P10632 490 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CDK8P49336 464 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 FAM227BQ96M60 508 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 PNMA3Q9UL41 463 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 C19orf81C9J6K1 198 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.572e-10■■■■□ 19.3
NELFE-208ENST00000481121 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 NAPBQ9H115 298 aa24.86■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SEPT2Q15019 361 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CPA4Q9UI42 421 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 MYH4Q9Y623 1939 aa24.85■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 LAMA4Q16363 1823 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 HTTP42858 3142 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 AKR1B1P15121 316 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 GUCY1A2P33402 732 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 C17orf99Q6UX52 265 aa24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
NELFE-208ENST00000481121 CCDC17Q96LX7 622 aa24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms