RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.39□□□□□ -1.39
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ANKRD28-210ENST00000479043 H3BS24 57 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 HPXP02790 462 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 DSC3Q14574 896 aa6.38□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.38□□□□□ -1.39
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ANKRD28-210ENST00000479043 STK35Q8TDR2 534 aa6.37□□□□□ -1.39
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ANKRD28-210ENST00000479043 SEMA7AO75326 666 aa6.36□□□□□ -1.39
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ANKRD28-210ENST00000479043 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
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ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 SULF2Q8IWU5 870 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 ASB16Q96NS5 453 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 SP110Q9HB58 689 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 GCM1Q9NP62 436 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 KCTD3Q9Y597 815 aa6.34□□□□□ -1.39
ANKRD28-210ENST00000479043 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 FANCGO15287 622 aa6.33□□□□□ -1.4
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ANKRD28-210ENST00000479043 FGD1P98174 961 aa6.33□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
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ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.32□□□□□ -1.4
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ANKRD28-210ENST00000479043 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 TRAK1Q9UPV9 953 aa6.32□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa6.31□□□□□ -1.4
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ANKRD28-210ENST00000479043 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.31□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 RFXAPO00287 272 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 SSPNQ14714 243 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ERICH6BQ5W0A0 696 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 PI16Q6UXB8 463 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 KCT2Q8NC54 265 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 DCDC2CA8MYV0 355 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 PLCB3Q01970 1234 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 EFEMP1Q12805 493 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 C12orf40Q86WS4 652 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 NME2P22392 152 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 FBF1Q8TES7 1133 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 SGPP1Q9BX95 441 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 PICK1Q9NRD5 415 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAMTS20P59510 1910 aa6.27□□□□□ -1.41
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