RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478603.5

C9orf3-216, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 802 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-216ENST00000478603 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 CERS3Q8IU89 383 aa27.74■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 NAV1Q8NEY1 1877 aa27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 GOLIM4O00461 696 aa27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 FLT3LGP49771 235 aa27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 BACE1P56817 501 aa27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 SLC34A2O95436 690 aa27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 PDE6AP16499 860 aa27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.71■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 GINM1Q9NU53 330 aa27.71■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.71■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 ZNF532Q9HCE3 1301 aa27.7■■■□□ 2.03
C9orf3-216ENST00000478603 USP17L10C9JJH3 530 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 ADCY3O60266 1144 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 GH2P01242 217 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 CCL5P13501 91 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 ELNP15502 786 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SHISA4Q96DD7 197 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SERPINB13Q9UIV8 391 aa27.7■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 UBXN2AP68543 259 aa27.69■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PDE3AQ14432 1141 aa27.69■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.69■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.69■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 C19orf81C9J6K1 198 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PLCD1P51178 756 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 TTC6Q86TZ1 520 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 COA7Q96BR5 231 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 RNF208Q9H0X6 261 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 EHD4Q9H223 541 aa27.68■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa27.67■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PEX10O60683 326 aa27.67■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SLFNL1Q499Z3 407 aa27.67■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 EVX2Q03828 476 aa27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 IRF5Q13568 498 aa27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 UNC93B1Q9H1C4 597 aa27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 EMILIN3Q9NT22 766 aa27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.66■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 INHAP05111 366 aa27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 GJB1P08034 283 aa27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 LCORLQ8N3X6 602 aa27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SDR42E1Q8WUS8 393 aa27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 MYH7P12883 1935 aa27.65■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 ATP5JP18859 108 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 SHMT1P34896 483 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 GJA8P48165 433 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 USP17L2Q6R6M4 530 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.64■■■□□ 2.02
C9orf3-216ENST00000478603 PLXNB2O15031 1838 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 HERVK_113P62684 666 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 LRRCC1Q9C099 1032 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 ARMT1Q9H993 441 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 TXNRD2Q9NNW7 524 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 MCM9Q9NXL9 1143 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 MORF4L1Q9UBU8 362 aa27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 CHGBP05060 677 aa27.62■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 FEZ1Q99689 392 aa27.62■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 HAUS7Q99871 368 aa27.62■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 ADD2P35612 726 aa27.61■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 GABPAQ06546 454 aa27.61■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 CYP2D6P10635 497 aa27.6■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 ACER1Q8TDN7 264 aa27.6■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 CABP5Q9NP86 173 aa27.6■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 GJD2Q9UKL4 321 aa27.6■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 MYH8P13535 1937 aa27.59■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 PRKAB2O43741 272 aa27.59■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 MBD4O95243 580 aa27.59■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 GUCY1A2P33402 732 aa27.59■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 RBPJLQ9UBG7 517 aa27.59■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 Q3C1V9 767 aa27.58■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 POTEEQ6S8J3 1075 aa27.58■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa27.58■■■□□ 2.01
C9orf3-216ENST00000478603 C12orf42Q96LP6 360 aa27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126.9 ms