RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477552.1

PTPRD-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRD, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-209ENST00000477552 TOMM22Q9NS69 142 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 RMND1Q9NWS8 449 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 IFNKQ9P0W0 207 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 KIF28PB7ZC32 967 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 LAD1O00515 517 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 NLRP3Q96P20 1036 aa9.57□□□□□ -0.88
PTPRD-209ENST00000477552 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.56□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 SYNE4Q8N205 404 aa9.55□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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PTPRD-209ENST00000477552 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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