RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475199.1

SYTL1-203, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2

Gene SYTL1, Length 2,235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-203ENST00000475199 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 TPM1P09493 284 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 PCP11498 1178 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 SPECC1Q5M775 1068 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 TMEM139Q8IV31 216 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 BCORQ6W2J9 1755 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 FOXN1O15353 648 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 SEC23AQ15436 765 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 INTS13Q9NVM9 706 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 TRIM75PA6NK02 468 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 TMEM232C9JQI7 657 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 SNAP23O00161 211 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 CYP7A1P22680 504 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 NR5A1Q13285 461 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 CABP5Q9NP86 173 aa14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 PLCD1P51178 756 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 FAM193AP78312 1265 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 GRIN1Q05586 938 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 CCDC82Q8N4S0 544 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 FERMT2Q96AC1 680 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.71□□□□□ -0.05
SYTL1-203ENST00000475199 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CALM1P0DP23 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CALM2P0DP24 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CALM3P0DP25 149 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CHRNDQ07001 517 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 UBXN4Q92575 508 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CSRNP2Q9H175 543 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 SLIT2O94813 1529 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 TNKSO95271 1327 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 NR1I3Q14994 352 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 TC2NQ8N9U0 490 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CAMTA2O94983 1202 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 SLFN14P0C7P3 912 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PRR29P0C7W0 189 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 KRT2P35908 639 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 MNS1Q8NEH6 495 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 OXER1Q8TDS5 423 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 GSDMAQ96QA5 445 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 A0A1B0GTH6 734 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 NTSR2O95665 410 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 FGRP09769 529 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 IQCA1Q86XH1 822 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 RAI14Q9P0K7 980 aa14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 FUT2Q10981 343 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 UBE4AQ14139 1066 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PKN1Q16512 942 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 SPATA1Q5VX52 437 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PDILTQ8N807 584 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PANX2Q96RD6 677 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CTAGE1Q96RT6 745 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 PLCH1Q4KWH8 1693 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 SEMA3EO15041 775 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CASQ1P31415 396 aa14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SYTL1-203ENST00000475199 CREBRFQ8IUR6 639 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms