RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470271.5

CTPS1-206, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 801 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-206ENST00000470271 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 EVI5LQ96CN4 794 aa23.92■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.92■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 PTPRFP10586 1907 aa23.92■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 GABPAQ06546 454 aa23.91■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.91■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.91■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.91■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.91■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2D6P10635 497 aa23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 SHMT1P34896 483 aa23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 WDR18Q9BV38 432 aa23.9■■□□□ 1.42
CTPS1-206ENST00000470271 M0R2C6 588 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 GPAA1O43292 621 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TLR2O60603 784 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 GH2P01242 217 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SP3Q02447 781 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 EVX2Q03828 476 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.89■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L12C9JPN9 530 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L21D6R901 530 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 GNAT2P19087 354 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 C12orf60Q5U649 245 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SWAP70Q9UH65 585 aa23.88■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ERO1AQ96HE7 468 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ABHD8Q96I13 439 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.87■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 HMGCS2P54868 508 aa23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CTR9Q6PD62 1173 aa23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CABP5Q9NP86 173 aa23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.86■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 BACE1P56817 501 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 MTMR2Q13614 643 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.85■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L10C9JJH3 530 aa23.84■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CYP2C8P10632 490 aa23.84■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.84■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TICAM2Q86XR7 235 aa23.84■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.84■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 C19orf81C9J6K1 198 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SMIM22K7EJ46 135 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 APPP05067 770 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 SBK1Q52WX2 424 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TREML2Q5T2D2 321 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 C17orf99Q6UX52 265 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 CPA4Q9UI42 421 aa23.83■■□□□ 1.41
CTPS1-206ENST00000470271 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.83■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 MYH8P13535 1937 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 TDO2P48775 406 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 RILPL2Q969X0 211 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 PNMA3Q9UL41 463 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 TRIM17Q9Y577 477 aa23.82■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 CAPN15O75808 1086 aa23.81■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 CDK8P49336 464 aa23.81■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.81■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.81■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.81■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 GUCY1A2P33402 732 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 SEPT2Q15019 361 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 ARHGEF6Q15052 776 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC17Q96LX7 622 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 FEZ1Q99689 392 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 EFCC1Q9HA90 598 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.8■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 PDE4AP27815 886 aa23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 KIF22Q14807 665 aa23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.79■■□□□ 1.4
CTPS1-206ENST00000470271 HTTP42858 3142 aa23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms