RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469034.1

SUMO1-210, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, humanhuman

TSL 3

Gene SUMO1, Length 511 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1-210ENST00000469034 CCDC18Q5T9S5 1454 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 SAMD9Q5K651 1589 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 HFM1A2PYH4 1435 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 UACAQ9BZF9 1416 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 ANP32CO43423 234 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 GRM2Q14416 872 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.54□□□□□ -1.36
SUMO1-210ENST00000469034 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.54□□□□□ -1.36
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SUMO1-210ENST00000469034 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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SUMO1-210ENST00000469034 CD320Q9NPF0 282 aa6.54□□□□□ -1.36
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SUMO1-210ENST00000469034 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.53□□□□□ -1.36
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SUMO1-210ENST00000469034 ARHGEF11O15085 1522 aa6.52□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 FCGRTP55899 365 aa6.52□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.52□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 PICK1Q9NRD5 415 aa6.52□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 CSADQ9Y600 493 aa6.52□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 NCOA2Q15596 1464 aa6.52□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa6.52□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 TOPBP1Q92547 1522 aa6.51□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.51□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 FANCD2Q9BXW9 1451 aa6.51□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 FMN1Q68DA7 1419 aa6.5□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 TONSLQ96HA7 1378 aa6.5□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 H3BRB1 525 aa6.49□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 LINC00310P59036 64 aa6.48□□□□□ -1.37
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SUMO1-210ENST00000469034 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.48□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 C12orf40Q86WS4 652 aa6.48□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 ABHD4Q8TB40 342 aa6.48□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 KCNN1Q92952 543 aa6.48□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.48□□□□□ -1.37
SUMO1-210ENST00000469034 JAG2Q9Y219 1238 aa6.48□□□□□ -1.37
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