RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 OXR1Q8N573 874 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 ABTB2Q8N961 1025 aa4.2□□□□□ -1.74
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SHQ1-204ENST00000468347 PWWP2AQ96N64 755 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 CNTD2Q9H8S5 307 aa4.2□□□□□ -1.74
SHQ1-204ENST00000468347 ZSWIM5Q9P217 1185 aa4.2□□□□□ -1.74
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SHQ1-204ENST00000468347 CHST13Q8NET6 341 aa4.1□□□□□ -1.75
SHQ1-204ENST00000468347 WASH4PA8MWX3 477 aa4.09□□□□□ -1.75
SHQ1-204ENST00000468347 PRMT3O60678 531 aa4.09□□□□□ -1.75
SHQ1-204ENST00000468347 CBX7O95931 251 aa4.09□□□□□ -1.75
SHQ1-204ENST00000468347 YBX1P67809 324 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
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