RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.93■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 SPP2Q13103 211 aa24.92■■□□□ 1.58
VARS-218ENST00000459667 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 USP17L21D6R901 530 aa24.89■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa24.86■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 MTMR2Q13614 643 aa24.86■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.86■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.86■■□□□ 1.57
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VARS-218ENST00000459667 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.86■■□□□ 1.57
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VARS-218ENST00000459667 USP17L10C9JJH3 530 aa24.84■■□□□ 1.57
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VARS-218ENST00000459667 CYP2C8P10632 490 aa24.84■■□□□ 1.57
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VARS-218ENST00000459667 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.84■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
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VARS-218ENST00000459667 SBK1Q52WX2 424 aa24.83■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.83■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.83■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 CPA4Q9UI42 421 aa24.83■■□□□ 1.57
VARS-218ENST00000459667 C19orf81C9J6K1 198 aa24.82■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 FEZ1Q99689 392 aa24.82■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 TRIM17Q9Y577 477 aa24.82■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 GUCY1A2P33402 732 aa24.81■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.81■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.81■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.81■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 HELLSQ9NRZ9 838 aa24.81■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 AKR1B1P15121 316 aa24.79■■□□□ 1.56
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VARS-218ENST00000459667 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.79■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 CCDC17Q96LX7 622 aa24.79■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 FAM227BQ96M60 508 aa24.79■■□□□ 1.56
VARS-218ENST00000459667 EFCC1Q9HA90 598 aa24.79■■□□□ 1.56
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