RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452811.1

LRRTM1-207, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 1, humanhuman

TSL 5

Gene LRRTM1, Length 765 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM1-207ENST00000452811 BACE1P56817 501 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 DCTPP1Q9H773 170 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.24■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 FCGRTP55899 365 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 TTC6Q86TZ1 520 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.23■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 C19orf81C9J6K1 198 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 GDF11O95390 407 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 MYPNQ86TC9 1320 aa22.22■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 ADD2P35612 726 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 MTMR2Q13614 643 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
LRRTM1-207ENST00000452811 USP17L10C9JJH3 530 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 PLCD1P51178 756 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 GABPAQ06546 454 aa22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 PRKCZQ05513 592 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 LCORLQ8N3X6 602 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 RAET1EQ8TD07 263 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 BCL11AQ9H165 835 aa22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 GH2P01242 217 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 GRK4P32298 578 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 SHMT1P34896 483 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 UBE3CQ15386 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 GABRQQ9UN88 632 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 MYH8P13535 1937 aa22.18■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.17■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 IRF5Q13568 498 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 C12orf42Q96LP6 360 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ARMT1Q9H993 441 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.16■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 FLT3LGP49771 235 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 MTFR1Q15390 333 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
LRRTM1-207ENST00000452811 MBD4O95243 580 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 GUCY1A2P33402 732 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 EVX2Q03828 476 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.14■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 PLXNB2O15031 1838 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 PRKAB2O43741 272 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 CHGBP05060 677 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 COA7Q96BR5 231 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 CABP5Q9NP86 173 aa22.13■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 ADCY3O60266 1144 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 USP14P54578 494 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 HERVK_113P62684 666 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 SWAP70Q9UH65 585 aa22.12■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 UBXN2AP68543 259 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 ACER1Q8TDN7 264 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 GPATCH3Q96I76 525 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 GJD2Q9UKL4 321 aa22.11■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 CYP2D6P10635 497 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 C12orf60Q5U649 245 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.1■■□□□ 1.13
LRRTM1-207ENST00000452811 USP17L15C9J2P7 530 aa22.09■■□□□ 1.13
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