RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 HTATIP2Q9BUP3 242 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-208ENST00000438888 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-208ENST00000438888 MGAMO43451 1857 aa15.09■□□□□ 0.01
PRAME-208ENST00000438888 GDF11O95390 407 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 SGPL1O95470 568 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 BAG3O95817 575 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 TFRCP02786 760 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 IRF5Q13568 498 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 MTMR2Q13614 643 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 ADGRA1Q86SQ6 560 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 BCL11AQ9H165 835 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 FLT1P17948 1338 aa15.08■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 ZAP70P43403 619 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.07■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PEX10O60683 326 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PLCG2P16885 1265 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PDE4AP27815 886 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 JAG1P78504 1218 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 AACSQ86V21 672 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 SKAP1Q86WV1 359 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 DNAJC18Q9H819 358 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 GPR108Q9NPR9 543 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 PALD1Q9ULE6 856 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.06■□□□□ 0
PRAME-208ENST00000438888 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 NR2E3Q9Y5X4 410 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.05■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 EVI5O60447 810 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 IDH1O75874 414 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 ASNSP08243 561 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 CYP7A1P22680 504 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 PPP4CP60510 307 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 TRIM32Q13049 653 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 SIPA1L1O43166 1804 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 HMGCRP04035 888 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 HLA-DOAP06340 250 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 CYP2B6P20813 491 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 BACE1P56817 501 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 WDR18Q9BV38 432 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.03■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 SALL3Q9BXA9 1300 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 MX1P20591 662 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 USP5P45974 858 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 MAGEB6Q8N7X4 407 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 GPATCH3Q96I76 525 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.02■□□□□ -0
PRAME-208ENST00000438888 USP17L10C9JJH3 530 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 GH2P01242 217 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 HERVK_113P62684 666 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 TRIB2Q92519 343 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 MORF4L1Q9UBU8 362 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 GJD2Q9UKL4 321 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 SZT2Q5T011 3432 aa15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 PDE1AP54750 535 aa15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 NECAB2Q7Z6G3 386 aa15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 FEZ1Q99689 392 aa15□□□□□ -0.01
PRAME-208ENST00000438888 ANTXR1Q9H6X2 564 aa15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms