RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 SPTLC2O15270 562 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 CLCN1P35523 988 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.58■■□□□ 1.05
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP6R2O75170 966 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC178Q5BJE1 867 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SLF2Q8IX21 1173 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 JMYQ8N9B5 988 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 BCS1LQ9Y276 419 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CLIC4Q9Y696 253 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MRVI1Q9Y6F6 885 aa21.58■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 KINO60870 393 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC39A14Q15043 492 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FSIP1Q8NA03 581 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 AIFM3Q96NN9 605 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MMP1P03956 469 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CAMK4Q16566 473 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PIM2Q9P1W9 311 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH6P13533 1939 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PLCG2P16885 1265 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 C12orf60Q5U649 245 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 H0YIN7 160 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 NUP133Q8WUM0 1156 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 XBP1P17861 261 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE6BP35913 854 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 USP5P45974 858 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 TROAPQ12815 778 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKS1AQ92625 1134 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP3K14Q99558 947 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 NPR1P16066 1061 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CMA1P23946 247 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 STK11IPQ8N1F8 1099 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FUT2Q10981 343 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 GAKO14976 1311 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPAQ15257 358 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.044e-7■■□□□ 11.4
SH3BP2-202ENST00000435136 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 POLLQ9UGP5 575 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM22K7EJ46 135 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SRGNP10124 158 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ALDH1B1P30837 517 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 DGKHQ86XP1 1220 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 COA1Q9GZY4 146 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 FOCADQ5VW36 1801 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 TIGD1Q96MW7 591 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 JAG2Q9Y219 1238 aa21.52■■□□□ 1.04
SH3BP2-202ENST00000435136 PRDM1O75626 825 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 STX1AQ16623 288 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 USP25Q9UHP3 1055 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 GRIN3BO60391 1043 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 GUCY1A2P33402 732 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP2-202ENST00000435136 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms