RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 DNAJA2O60884 412 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 SOX9P48436 509 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 CDK5R2Q13319 367 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 LCE1DQ5T752 114 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 SEC16BQ96JE7 1060 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 TMEM87BQ96K49 555 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 TBC1D32Q96NH3 1257 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 C8orf37Q96NL8 207 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 C1GALT1Q9NS00 363 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.79□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ATE1O95260 518 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 H2AFB2P0C5Z0 115 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ARID5AQ03989 594 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 MLECQ14165 292 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FBXL6Q8N531 539 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 FAM13CQ8NE31 585 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 XAGE3Q8WTP9 111 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 MFSD14AQ96MC6 490 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.78□□□□□ -1.32
RBM39-211ENST00000426951 DYRK3O43781 588 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 ADMP35318 185 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 RNF43Q68DV7 783 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SLC6A19Q695T7 634 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SHISA5Q8N114 240 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.335e-63■■■□□ 19.1
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RBM39-211ENST00000426951 FOXQ1Q9C009 403 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SEMA6BQ9H3T3 888 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 LRIG2O94898 1065 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 NFIAQ12857 509 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 FAM87AP0C7U9 286 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 IMPDH2P12268 514 aa6.75□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 MIPEPQ99797 713 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 GMIPQ9P107 970 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 FAM170BA6NMN3 283 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 LEFTY1O75610 366 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SLITRK5O94991 958 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 IGLV1-40P01703 118 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 FGRP09769 529 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.74□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 GIMAP7Q8NHV1 300 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.74□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 ATG4CQ96DT6 458 aa6.74□□□□□ -1.33
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RBM39-211ENST00000426951 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.74□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 WDR64B1ANS9 1081 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 F13BP05160 661 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 RAG1P15918 1043 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 ZNF765Q7L2R6 523 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 RIN3Q8TB24 985 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 SHDQ96IW2 340 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 KIF2CQ99661 725 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 STRIP2Q9ULQ0 834 aa6.73□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 GSC2O15499 205 aa6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RBM39-211ENST00000426951 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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