RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 WDR18Q9BV38 432 aa23.64■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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UBXN4-202ENST00000415164 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L10C9JJH3 530 aa23.63■■□□□ 1.37
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UBXN4-202ENST00000415164 ATP8B2P98198 1209 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.63■■□□□ 1.37
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UBXN4-202ENST00000415164 STAP2Q9UGK3 403 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 GJD2Q9UKL4 321 aa23.63■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 RPTORQ8N122 1335 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 HERVK_113P62684 666 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 SSH3Q8TE77 659 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.62■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.62■■□□□ 1.37
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UBXN4-202ENST00000415164 C19orf81C9J6K1 198 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 CAPN2P17655 700 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 USP5P45974 858 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 PDE3AQ14432 1141 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 TRIB2Q92519 343 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 SZT2Q5T011 3432 aa23.61■■□□□ 1.37
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UBXN4-202ENST00000415164 FEZ1Q99689 392 aa23.6■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 PRO3102Q9H379 93 aa23.6■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.6■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.6■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.59■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 GH2P01242 217 aa23.59■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF3Q9H094 633 aa23.59■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 SIPA1L1O43166 1804 aa23.59■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.58■■□□□ 1.37
UBXN4-202ENST00000415164 SYN1P17600 705 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 MAPK4P31152 587 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 ERVK-9P63128 1117 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 ERVK-24P63145 666 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 WDR78Q5VTH9 848 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 BCL11AQ9H165 835 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.57■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 GINM1Q9NU53 330 aa23.57■■□□□ 1.36
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UBXN4-202ENST00000415164 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.56■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 Q3C1V9 767 aa23.56■■□□□ 1.36
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UBXN4-202ENST00000415164 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 PORCNQ9H237 461 aa23.56■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
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UBXN4-202ENST00000415164 GPR142Q7Z601 462 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.54■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 A0A1W2PPC1 479 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 RLBP1P12271 317 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 RGS2P41220 211 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 MAP3K12Q12852 859 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 CCL14Q16627 93 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 AACSQ86V21 672 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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UBXN4-202ENST00000415164 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-202ENST00000415164 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBXN4-202ENST00000415164 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L11C9JVI0 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L18D6R9N7 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L22D6RA61 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L19D6RCP7 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L20D6RJB6 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 USP17L24Q0WX57 530 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 TTC6Q86TZ1 520 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-202ENST00000415164 CERS3Q8IU89 383 aa23.51■■□□□ 1.35
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