RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-209ENST00000395789 SLC44A5Q8NCS7 719 aa15.98■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.98■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa15.98■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 PICK1Q9NRD5 415 aa15.98■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CXCL11O14625 94 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 GNAT2P19087 354 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 LBX1P52954 281 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 SNAPC2Q13487 334 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CCL15Q16663 113 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 VPS53Q5VIR6 699 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 BEGAINQ9BUH8 593 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa15.97■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 GDF11O95390 407 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 NEFLP07196 543 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 ASNSP08243 561 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CETPP11597 493 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 GUCY1A2P33402 732 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 GPAT2Q6NUI2 795 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 IFNL3Q8IZI9 196 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 TAOK2Q9UL54 1235 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 ROBO3Q96MS0 1386 aa15.96■□□□□ 0.15
C6orf48-209ENST00000395789 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 USP17L5A8MUK1 530 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 BTBD19C9JJ37 291 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CDK8P49336 464 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 WDR18Q9BV38 432 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 IL25Q9H293 177 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 PRDM10Q9NQV6 1147 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 GINM1Q9NU53 330 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 MYH8P13535 1937 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa15.95■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TRIM75PA6NK02 468 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TBC1D8O95759 1140 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 GH2P01242 217 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 SPP2Q13103 211 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 DDRGK1Q96HY6 314 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 SWAP70Q9UH65 585 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 LOC285556D6RIA3 1793 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CCDC171Q6TFL3 1326 aa15.94■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ALDH1A1P00352 501 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 DGKZQ13574 1117 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ALX1Q15699 326 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ABCB5Q2M3G0 1257 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TBC1D2Q9BYX2 928 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 MINDY4BA8MYZ0 360 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 APPP05067 770 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 AKR1B1P15121 316 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TDO2P48775 406 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CRHR2Q13324 411 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ANKRD23Q86SG2 305 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 SIAH1Q8IUQ4 282 aa15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 FGAP02671 866 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 RASA1P20936 1047 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CHMLP26374 656 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 BACE1P56817 501 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 PPARAQ07869 468 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 SEPT2Q15019 361 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 AMOTL1Q8IY63 956 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 NACAP1Q9BZK3 213 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ADGRA2Q96PE1 1338 aa15.91■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 GPR25O00155 361 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 HIP1O00291 1037 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 HMGCS2P54868 508 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 TREML2Q5T2D2 321 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ACER1Q8TDN7 264 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 CCDC17Q96LX7 622 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 NAPBQ9H115 298 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 AS3MTQ9HBK9 375 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 ZMYM6O95789 1325 aa15.9■□□□□ 0.14
C6orf48-209ENST00000395789 A0A1W2PRG0 241 aa15.89■□□□□ 0.13
C6orf48-209ENST00000395789 PDHXO00330 501 aa15.89■□□□□ 0.13
C6orf48-209ENST00000395789 CAP1Q01518 475 aa15.89■□□□□ 0.13
C6orf48-209ENST00000395789 MTMR2Q13614 643 aa15.89■□□□□ 0.13
C6orf48-209ENST00000395789 RAB3GAP1Q15042 981 aa15.89■□□□□ 0.13
C6orf48-209ENST00000395789 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms