RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392449.4

PTPRK-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 1,456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-208ENST00000392449 PNMA3Q9UL41 463 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 HLA-DOAP06340 250 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 ASNSP08243 561 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 EVX2Q03828 476 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 WDR18Q9BV38 432 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 NAV1Q8NEY1 1877 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 ADCY3O60266 1144 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 BACE1P56817 501 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 KIF1BPQ96EK5 621 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 RNF208Q9H0X6 261 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.18■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 GOLIM4O00461 696 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 IGSF3O75054 1194 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 GH2P01242 217 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 PDE6AP16499 860 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 SLFNL1Q499Z3 407 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 SLAIN1Q8ND83 568 aa20.17■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 HMMRO75330 724 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 INHAP05111 366 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 PLCD1P51178 756 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRK-208ENST00000392449 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 USP17L10C9JJH3 530 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 UBXN2AP68543 259 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 COA7Q96BR5 231 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PLXNB2O15031 1838 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CHGBP05060 677 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 GJB1P08034 283 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 GJA8P48165 433 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TATDN1Q6P1N9 297 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 BOLA2Q9H3K6 86 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.13■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 IRF5Q13568 498 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CERS3Q8IU89 383 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 LCORLQ8N3X6 602 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SDR42E1Q8WUS8 393 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 EHD4Q9H223 541 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 C19orf81C9J6K1 198 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 RAB11FIP3O75154 756 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SHMT1P34896 483 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 HERVK_113P62684 666 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CYP2D6P10635 497 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TRIM32Q13049 653 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 TTC6Q86TZ1 520 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 ACER1Q8TDN7 264 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 ARMT1Q9H993 441 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 GINM1Q9NU53 330 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 GJD2Q9UKL4 321 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CEP290O15078 2479 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 KCNA4P22459 653 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 FEZ1Q99689 392 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PAG1Q9NWQ8 432 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.1■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 H0YGN5 161 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SMIM22K7EJ46 135 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PRKAB2O43741 272 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 Q3C1V9 767 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 DEFB118Q96PH6 123 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 PAGR1Q9BTK6 254 aa20.09■□□□□ 0.81
PTPRK-208ENST00000392449 SGPL1O95470 568 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms