RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 FLT3LGP49771 235 aa21.43■■□□□ 1.02
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SYP-202ENST00000376303 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 COA7Q96BR5 231 aa21.43■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 C19orf81C9J6K1 198 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 ADCY3O60266 1144 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 GJB1P08034 283 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 CCL5P13501 91 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 IRF5Q13568 498 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 MTMR2Q13614 643 aa21.42■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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SYP-202ENST00000376303 USP17L10C9JJH3 530 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 GDF11O95390 407 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 GJA8P48165 433 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 JAG1P78504 1218 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 RNF208Q9H0X6 261 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 CEP290O15078 2479 aa21.41■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 APBB1O00213 710 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 RAB11FIP3O75154 756 aa21.4■■□□□ 1.02
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SYP-202ENST00000376303 TTC6Q86TZ1 520 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 SHISA4Q96DD7 197 aa21.4■■□□□ 1.02
SYP-202ENST00000376303 EHD4Q9H223 541 aa21.4■■□□□ 1.02
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SYP-202ENST00000376303 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 TATDN1Q6P1N9 297 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 SERPINB13Q9UIV8 391 aa21.39■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.38■■□□□ 1.01
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SYP-202ENST00000376303 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 ELNP15502 786 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.37■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 GH2P01242 217 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 INHAP05111 366 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 PDE6AP16499 860 aa21.36■■□□□ 1.01
SYP-202ENST00000376303 CAPN2P17655 700 aa21.36■■□□□ 1.01
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SYP-202ENST00000376303 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.36■■□□□ 1.01
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SYP-202ENST00000376303 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.32■■□□□ 1
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SYP-202ENST00000376303 RAB3GAP1Q15042 981 aa21.32■■□□□ 1
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SYP-202ENST00000376303 C12orf42Q96LP6 360 aa21.32■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 HTATIP2Q9BUP3 242 aa21.32■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.32■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 SHMT1P34896 483 aa21.31■■□□□ 1
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SYP-202ENST00000376303 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.31■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 RBPJLQ9UBG7 517 aa21.31■■□□□ 1
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SYP-202ENST00000376303 GABPAQ06546 454 aa21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 DPF3Q92784 378 aa21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 DEFB118Q96PH6 123 aa21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.3■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.3■■□□□ 1
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SYP-202ENST00000376303 USP17L11C9JVI0 530 aa21.29■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 USP17L18D6R9N7 530 aa21.29■■□□□ 1
SYP-202ENST00000376303 USP17L22D6RA61 530 aa21.29■■□□□ 1
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