RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358071.8

RAD9B-201, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAD9B, Length 2,843 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9B-201ENST00000358071 MYSM1Q5VVJ2 828 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 USP17L2Q6R6M4 530 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 FSIP1Q8NA03 581 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ESR2Q92731 530 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 UBA5Q9GZZ9 404 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TNMDQ9H2S6 317 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CABP5Q9NP86 173 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 RAD17O75943 681 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ADRA2BP18089 450 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TROAPQ12815 778 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 STK38Q15208 465 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ALX1Q15699 326 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SLC15A2Q16348 729 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ANO6Q4KMQ2 910 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 KRT23Q9C075 422 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PLSCR1O15162 318 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 RHBDL3P58872 404 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SNAP25P60880 206 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PKN1Q16512 942 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.39□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 MYH6P13533 1939 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 FLT1P17948 1338 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 GNAT2P19087 354 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TMEM87BQ96K49 555 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 BRIP1Q9BX63 1249 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CYTH3O43739 400 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TSPY3P0CV98 308 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TSPY8P0CW00 308 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 C12orf60Q5U649 245 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 FZD1Q9UP38 647 aa8.38□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CLRN2A0PK11 232 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 BBOX1O75936 387 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 LIFRP42702 1097 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 IQCA1Q86XH1 822 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 WDR66Q8TBY9 1149 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 GJA10Q969M2 543 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CEP95Q96GE4 821 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 FUCA2Q9BTY2 467 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 DUOX1Q9NRD9 1551 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF831Q5JPB2 1677 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 YDJCA8MPS7 323 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SLC16A2P36021 539 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TYRO3Q06418 890 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PLIN2Q99541 437 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SPTLC2O15270 562 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 IL1R1P14778 569 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 RASA1P20936 1047 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ATP2B4P23634 1241 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CDK8P49336 464 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ZNF174Q15697 407 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 ANO1Q5XXA6 986 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 SHC4Q6S5L8 630 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 PNMA1Q8ND90 353 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 USP40Q9NVE5 1235 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.36□□□□□ -1.07
RAD9B-201ENST00000358071 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms