RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354376.3

C9orf163-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 163, humanhuman

Gene C9orf163, Length 2,572 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163-201ENST00000354376 FUT2Q10981 343 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 WASF1Q92558 559 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 HPSEQ9Y251 543 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 SBF2Q86WG5 1849 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 HSPA1LP34931 641 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 TROAPQ12815 778 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 FGRP09769 529 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 PNOCQ13519 176 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 CEP57L1Q8IYX8 460 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 CABP5Q9NP86 173 aa26.02■■□□□ 1.76
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 FOXN1O15353 648 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 LONRF3Q496Y0 759 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 RESP18Q5W5W9 173 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 MTA3Q9BTC8 594 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.01■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 CAVIN2O95810 425 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 GPSM2P81274 684 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 CATIPQ7Z7H3 387 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 IQCA1Q86XH1 822 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 RGS22Q8NE09 1264 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 WNT7AO00755 349 aa26■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 GYS1P13807 737 aa25.99■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 ADAMTS3O15072 1205 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 JMYQ8N9B5 988 aa25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 LDHBP07195 334 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 USP49Q70CQ1 688 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SARM1Q6SZW1 724 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.97■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 MYH6P13533 1939 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 CUTAO60888 179 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 NLRP12P59046 1061 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
C9orf163-201ENST00000354376 TSPY2A6NKD2 308 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 SERPINB2P05120 415 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RCAN1P53805 252 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 XDHP47989 1333 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ORC4O43929 436 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TRIM37O94972 964 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 UFL1O94874 794 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 USP5P45974 858 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TMTC3Q6ZXV5 915 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PDILTQ8N807 584 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 UQCRHLA0A096LP55 91 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 UQCRHP07919 91 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 IL17RBQ9NRM6 502 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 MTMR7Q9Y216 660 aa25.94■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 NCAPHQ15003 741 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 TFAP4Q01664 338 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 DDR1Q08345 913 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa25.93■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 USP17L3A6NCW0 530 aa25.92■■□□□ 1.74
C9orf163-201ENST00000354376 USP17L4A6NCW7 530 aa25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms