RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 NPR1P16066 1061 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 GSTO1P78417 241 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 KCND1Q9NSA2 647 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MYH15Q9Y2K3 1946 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 C6orf229H3BNL8 230 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MSL1Q68DK7 614 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 LAMB1P07942 1786 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 NTRK3Q16288 839 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 UBAC1Q9BSL1 405 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 PDE6BP35913 854 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 EVX2Q03828 476 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SEC23AQ15436 765 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SBK1Q52WX2 424 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 TMTC2Q8N394 836 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CFAP45Q9UL16 551 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CYP2D6P10635 497 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS1-204ENST00000352260 LDHCP07864 332 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CEP135Q66GS9 1140 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SARM1Q6SZW1 724 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 RGS22Q8NE09 1264 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 PHKBQ93100 1093 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ERO1AQ96HE7 468 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 CBX8Q9HC52 389 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 TNKSO95271 1327 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS1-204ENST00000352260 PRDM1O75626 825 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 PPP4CP60510 307 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 DRC7Q8IY82 874 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TIGD1Q96MW7 591 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ORC4O43929 436 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ALDH1B1P30837 517 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 RCAN1P53805 252 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ATL3Q6DD88 541 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ALG1Q9BT22 464 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TRIM5Q9C035 493 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TSPYL1Q9H0U9 437 aa21.45■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 RTN1Q16799 776 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 MASTLQ96GX5 879 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 PGBD1Q96JS3 809 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 AIFM3Q96NN9 605 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 FAM205AQ6ZU69 1335 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 PTGER2P43116 358 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 USP5P45974 858 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 OLFM4Q6UX06 510 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 USP28Q96RU2 1077 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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SPNS1-204ENST00000352260 MTFR1LQ9H019 292 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 MCM9Q9NXL9 1143 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 RIMBP2O15034 1052 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 USP17L8P0C7I0 530 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 IFNAR1P17181 557 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 LIG1P18858 919 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 LUZP1Q86V48 1076 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SLC16A10Q8TF71 515 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SGIP1Q9BQI5 828 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SLC26A6Q9BXS9 759 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 SPON1Q9HCB6 807 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS1-204ENST00000352260 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.41■■□□□ 1.02
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