RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301021.7

TRAPPC2L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 2 like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC2L, Length 2,215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A0A0U1RQJ8 604 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SHTN1A0MZ66 631 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC51Q96ER9 411 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HAUS7Q99871 368 aa20.21■□□□□ 0.83
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PLCH1Q4KWH8 1693 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SATB1Q01826 763 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTPAQ15257 358 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NT5DC1Q5TFE4 455 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CABS1Q96KC9 395 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.2■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MYL6BP14649 208 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LONRF3Q496Y0 759 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MFAP3LO75121 409 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRIML1Q8N9V2 468 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KBTBD3Q8NAB2 608 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAN1B1Q9UKM7 699 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PALLDQ8WX93 1383 aa20.19■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6CA6NDK9 693 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6DP0CG33 693 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GGCXP38435 758 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TDO2P48775 406 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RBL2Q08999 1139 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHGBP05060 677 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GPTP24298 496 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PBX1P40424 430 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNNI3KQ59H18 835 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CNGA4Q8IV77 575 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 BCAS4Q8TDM0 211 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.18■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 A6NNZ2 444 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 XAGE2Q96GT9 111 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AGPSO00116 658 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GRIN2DO15399 1336 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NRAPQ86VF7 1730 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 AMOTL1Q8IY63 956 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.17■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FSBPO95073 299 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SARSP49591 514 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MORC3Q14149 939 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMTC1Q8IUR5 882 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 MAP3K14Q99558 947 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TMOD3Q9NYL9 352 aa20.16■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ARHGAP25P42331 645 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FNTAP49354 379 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COPS6Q7L5N1 327 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CEP120Q8N960 986 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 COPRSQ9NQ92 184 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PAPPAQ13219 1627 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TNS2Q63HR2 1409 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 POSTNQ15063 836 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CHST3Q7LGC8 479 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 FBXO41Q8TF61 875 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 PIGBQ92521 554 aa20.15■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 ITIH6Q6UXX5 1313 aa20.14■□□□□ 0.82
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CCDC189A1A4V9 331 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 CPLX1O14810 134 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 TEX33O43247 280 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 NEDD9Q14511 834 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.14■□□□□ 0.81
TRAPPC2L-201ENST00000301021 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.14■□□□□ 0.81
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