RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293973.1

NTN3-201, Transcript of netrin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NTN3, Length 1,986 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN3-201ENST00000293973 IQCA1Q86XH1 822 aa29.56■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 SULF1Q8IWU6 871 aa29.56■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TMEM87BQ96K49 555 aa29.56■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.56■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TSPY3P0CV98 308 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TSPY8P0CW00 308 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 FBXL16Q8N461 479 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 UBAC1Q9BSL1 405 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TBC1D12O60347 775 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 MTA3Q9BTC8 594 aa29.55■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 BECN1Q14457 450 aa29.54■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TATDN1Q6P1N9 297 aa29.54■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 BRF1Q92994 677 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TMEM67Q5HYA8 995 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 KRT26Q7Z3Y9 468 aa29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 MAP3K10Q02779 954 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 TNKSO95271 1327 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ERICH2A1L162 156 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 AKR1B1P15121 316 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 CCDC17Q96LX7 622 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 NMRK2Q9NPI5 230 aa29.52■■■□□ 2.32
NTN3-201ENST00000293973 ADM5C9JUS6 153 aa29.51■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 NMT2O60551 498 aa29.51■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa29.51■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.51■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 HOOK2Q96ED9 719 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 LY9Q9HBG7 655 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 POTEIP0CG38 1075 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 POTEJP0CG39 1038 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 CLEC11AQ9Y240 323 aa29.5■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 LIFRP42702 1097 aa29.49■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 WTAPQ15007 396 aa29.49■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SEC23AQ15436 765 aa29.49■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.49■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 APOBRQ0VD83 1088 aa29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 DCAF15Q66K64 600 aa29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 TMX3Q96JJ7 454 aa29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SENP2Q9HC62 589 aa29.48■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 CCDC178Q5BJE1 867 aa29.47■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SGMS1Q86VZ5 419 aa29.47■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 GDF11O95390 407 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 DLK2Q6UY11 383 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 USP48Q86UV5 1035 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 TMTC2Q8N394 836 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 EVCP57679 992 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 ABCB5Q2M3G0 1257 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 CDC37L1Q7L3B6 337 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 CEP95Q96GE4 821 aa29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 NFXL1Q6ZNB6 911 aa29.45■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
NTN3-201ENST00000293973 LARGE1O95461 756 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 ME3Q16798 604 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 RCSD1Q6JBY9 416 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 LDHDQ86WU2 507 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 DGKHQ86XP1 1220 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 BRPF3Q9ULD4 1205 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 STX8Q9UNK0 236 aa29.44■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 CCDC69A6NI79 296 aa29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 ZNF341Q9BYN7 854 aa29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 GH2P01242 217 aa29.43■■■□□ 2.3
NTN3-201ENST00000293973 SLC4A3P48751 1232 aa29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms