RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.13■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PRDX5P30044 214 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 GRIN1Q05586 938 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FAM182BQ5T319 152 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 IFNKQ9P0W0 207 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FGRP09769 529 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 ATP2B1P20020 1258 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 SHISA4Q96DD7 197 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 LAMB1P07942 1786 aa22.12■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PTPREP23469 700 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CABP5Q9NP86 173 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 JAG2Q9Y219 1238 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PKN1Q16512 942 aa22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 NHSQ6T4R5 1651 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP21-201ENST00000289865 NPHP1O15259 732 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 SKILP12757 684 aa22.1■■□□□ 1.13
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USP21-201ENST00000289865 TM4SF1P30408 202 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FUT2Q10981 343 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TSC1Q92574 1164 aa22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CCZ1BP86790 482 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FOXN1O15353 648 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 GSDMDP57764 484 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TROAPQ12815 778 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CALM1P0DP23 149 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CALM2P0DP24 149 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CALM3P0DP25 149 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 CYP2D6P10635 497 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 TMC6Q7Z403 805 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.08■■□□□ 1.13
USP21-201ENST00000289865 FAM205CA6NFA0 338 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ORC4O43929 436 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 NMT2O60551 498 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 DDAH1O94760 285 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 KRT2P35908 639 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 OLFM4Q6UX06 510 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.08■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TNNT1P13805 278 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.07■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ATP1A3P13637 1013 aa22.06■■□□□ 1.12
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USP21-201ENST00000289865 MYL5Q02045 173 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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USP21-201ENST00000289865 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SLC51AQ86UW1 340 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 USP21Q9UK80 565 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 USP27XA6NNY8 438 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 POSTNQ15063 836 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 TRIM75PA6NK02 468 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 RFC4P35249 363 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.05■■□□□ 1.12
USP21-201ENST00000289865 MAP7D2Q96T17 732 aa22.05■■□□□ 1.12
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