RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 SAMD15Q9P1V8 674 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PQ27 194 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PQ64 194 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 A0A1W2PQD8 194 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 MACROD2A1Z1Q3 448 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 FLOT1O75955 427 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 BRD1O95696 1058 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 FOSP01100 380 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 IGSF22Q8N9C0 903 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ANAPC4Q9UJX5 808 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ARHGEF35A5YM69 484 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LIG1P18858 919 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 APBA1Q02410 837 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 POSTNQ15063 836 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZNF569Q5MCW4 686 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 COPRSQ9NQ92 184 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LCMT1Q9UIC8 334 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 COMMD10Q9Y6G5 202 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PTCH1Q13635 1447 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PPARAQ07869 468 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 C8orf37Q96NL8 207 aa10.07□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LONP1P36776 959 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DNM2P50570 870 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 SEMA3FQ13275 785 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 UBE4AQ14139 1066 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC122Q5T0U0 273 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LGSNQ5TDP6 509 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PANK2Q9BZ23 570 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ABCC12Q96J65 1359 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ERICH4A6NGS2 130 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 FANCCQ00597 558 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 SEPT2Q15019 361 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PPP1R7Q15435 360 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 GRK7Q8WTQ7 553 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ADGRB3O60242 1522 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CBX1P83916 185 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CALCRLQ16602 461 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 POTEDQ86YR6 584 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PLEKHF1Q96S99 279 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 TPCN1Q9ULQ1 816 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 FYB2Q5VWT5 728 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 BBOF1Q8ND07 529 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LRWD1Q9UFC0 647 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ERVV-1B6SEH8 477 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 EBAG9O00559 213 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 AK8Q96MA6 479 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 LRRC2Q9BYS8 371 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ARMT1Q9H993 441 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 FAM184BQ9ULE4 1060 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 USH1CQ9Y6N9 552 aa10.06□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 VWA3AA6NCI4 1184 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 TRAF5O00463 557 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PPP6R2O75170 966 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DCAF15Q66K64 600 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CABP7Q86V35 215 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 TXNDC16Q9P2K2 825 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 E7EWF7 191 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 EEF2P13639 858 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PAK2Q13177 524 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 KRT40Q6A162 431 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 MIGA1Q8NAN2 632 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 SLAIN2Q9P270 581 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 DLC1Q96QB1 1528 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 B4E1Z4 1266 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 CCDC17Q96LX7 622 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.05□□□□□ -0.8
PTPRB-201ENST00000261266 MTA3Q9BTC8 594 aa10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms