RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP131Q9UPN4 1083 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K12Q12852 859 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MROH5Q6ZUA9 1318 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A1B0GTH6 734 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PIP4K2BP78356 416 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MYH3P11055 1940 aa25.29■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 DOCK2Q92608 1830 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 WTAPQ15007 396 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF827Q17R98 1081 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TMTC2Q8N394 836 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ARMT1Q9H993 441 aa25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 UBAP1LF5GYI3 381 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PIGBQ92521 554 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PANX2Q96RD6 677 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CHD4Q14839 1912 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GNAT2P19087 354 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 NR5A1Q13285 461 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa25.27■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D8O95759 1140 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 RABGGTAQ92696 567 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 RASGRF1Q13972 1273 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CSRNP2Q9H175 543 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.26■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CERKQ8TCT0 537 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 STRN4Q9NRL3 753 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 FANCBQ8NB91 859 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC5A1P13866 664 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 USP49Q70CQ1 688 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 OXER1Q8TDS5 423 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC175P0C221 793 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 EPC1Q9H2F5 836 aa25.24■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ERICH2A1L162 156 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKAB2O43741 272 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SASH3O75995 380 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA1Q5VX52 437 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 PBX1P40424 430 aa25.23■■□□□ 1.63
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HTATSF1-201ENST00000218364 DHX58Q96C10 678 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 DESI2Q9BSY9 194 aa25.23■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX35Q5T0J7 233 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF654Q8IZM8 581 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 LCORLQ8N3X6 602 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CABP5Q9NP86 173 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TDO2P48775 406 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA1Q92805 767 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CUL4BQ13620 913 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP2R5BQ15173 497 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 BCORQ6W2J9 1755 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ERICH4A6NGS2 130 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 MTF1Q14872 753 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 AK7Q96M32 723 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRG1Q9Y653 693 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 TEX33O43247 280 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKAL1Q5VV42 579 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC82Q8N4S0 544 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.21■■□□□ 1.63
HTATSF1-201ENST00000218364 SEMA3EO15041 775 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 TOMM22Q9NS69 142 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.2■■□□□ 1.62
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM75PA6NK02 468 aa25.2■■□□□ 1.62
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