RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cdc45Q9Z1X9 566 aa33.51■■■□□ 2.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NrapQ80XB4 1728 aa33.51■■■□□ 2.96
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stx8O88983 236 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ptpn12P35831 775 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mybl2P48972 704 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NogP97466 232 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ncf1Q09014 390 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rtn1Q8K0T0 780 aa33.51■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PogkQ80TC5 607 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbc1d5Q80XQ2 815 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ift74Q8BKE9 600 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gimap7Q8R379 293 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lman1lQ8VCD3 505 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dpp7Q9ET22 506 aa33.5■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dpp8Q80YA7 892 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ascc2Q91WR3 749 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mtmr4Q91XS1 1190 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stk32bQ9JJX8 414 aa33.49■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dcdc2bF7BCK0 340 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tacc1Q6Y685 774 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sgip1Q8VD37 806 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mad2l2Q9D752 211 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem47Q9JJG6 181 aa33.48■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myl3P09542 204 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp5P56399 858 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cpa2Q504N0 417 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cnot7Q60809 285 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif5P59325 429 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema3eP70275 775 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bag4Q8CI61 457 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wasf1Q8R5H6 559 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trmt112Q9DCG9 125 aa33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP33.47■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rasa1E9PYG6 1038 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LyarQ08288 388 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Babam1Q3UI43 333 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Oog3Q3UWY1 500 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Leo1Q5XJE5 667 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa33.46■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GnaqP21279 359 aa33.45■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Irf6P97431 467 aa33.45■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ano1Q8BHY3 960 aa33.45■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddit3P35639 168 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpr162Q3UN16 588 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slitrk3Q810B9 980 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ttll1Q91V51 423 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Terf2ipQ91VL8 393 aa33.44■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NpcdF8VQB8 469 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Usp50Q6P8X6 390 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ranbp6Q8BIV3 1105 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apbb1ipQ8R5A3 670 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Alppl2P24823 529 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LeprP48356 1162 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem39bQ810L4 492 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cep89Q9CZX2 791 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tjap1Q9DCD5 539 aa33.43■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa33.42■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 CtshP49935 333 aa33.42■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klrg2Q3UM83 387 aa33.42■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lgr6Q3UVD5 967 aa33.42■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atrnl1Q6A051 1378 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam205a1D3YZF6 1314 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tbc1d8bA3KGB4 1114 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 LdhaP06151 332 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nap1l2P51860 460 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glra4Q61603 456 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Arhgef6Q8K4I3 771 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa33.41■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zscan20B2KFW1 1030 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lca5Q80ST9 704 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Glis2Q8VDL9 521 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gpsm2Q8VDU0 679 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lzts2Q91YU6 671 aa33.4■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mical3Q8CJ19 1993 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cfap99A0A140LIX9 648 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Qrich1Q3UA37 777 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 R3hcc1Q8BSI6 488 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clstn1Q9EPL2 979 aa33.39■■■□□ 2.94
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Clrn2B2RVW2 232 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppfia3P60469 1194 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700013D24RikQ0P521 120 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Brip1Q5SXJ3 1174 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccp110Q7TSH4 1004 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Evc2Q8K1G2 1220 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cry2Q9R194 592 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Stk39Q9Z1W9 556 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Llgl2Q3TJ91 1027 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psen2Q61144 448 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam196bQ6GQV1 535 aa33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmprss11eQ5S248 423 aa33.37■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa33.36■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc82Q6PG04 518 aa33.36■■■□□ 2.93
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snapc2Q91XA5 359 aa33.36■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 59.9 ms