RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ctu1Q99J10 420 aa23.28■■□□□ 1.32
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Ltb-201ENSMUST00000025262 FliiQ9JJ28 1271 aa23.27■■□□□ 1.32
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Ltb-201ENSMUST00000025262 AoahO35298 574 aa23.26■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpd52Q62393 224 aa23.26■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 MthfsQ9D110 203 aa23.26■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam160b2Q80YR2 744 aa23.25■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 DnttP09838 530 aa23.24■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp24a1Q64441 514 aa23.24■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Prr11Q8BHE0 368 aa23.24■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lmcd1Q8VEE1 365 aa23.24■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Usp31E9Q6Y8 1344 aa23.24■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ptpn22P29352 802 aa23.23■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Col6a1Q04857 1025 aa23.23■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp2c29Q64458 490 aa23.22■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 PhkbQ7TSH2 1085 aa23.22■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Scfd2Q8BTY8 684 aa23.22■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgra1Q8C4G9 578 aa23.22■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pidd1Q9ERV7 915 aa23.22■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Parp2O88554 559 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp8b2P98199 1209 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Brip1Q5SXJ3 1174 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q8C5S3 137 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 E4f1Q8CCE9 783 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 HlcsQ920N2 722 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bco2Q99NF1 532 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 TnksQ6PFX9 1320 aa23.21■■□□□ 1.31
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prss40A6H6T1 365 aa23.2■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Celf5D3Z4T1 395 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Triml2E9PW10 424 aa23.2■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hoxc6P10629 235 aa23.2■■□□□ 1.3
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube3bQ9ES34 1070 aa23.2■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myh2G3UW82 1942 aa23.2■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abcc4E9Q236 1325 aa23.19■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sema3eP70275 775 aa23.19■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam178bQ24JP3 464 aa23.19■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem266Q8BZB3 538 aa23.19■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pla2g12bQ99P27 195 aa23.19■■□□□ 1.3
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Adam15O88839 864 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fgfr2P21803 821 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 ProcP33587 460 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dpf3P58269 378 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nploc4P60670 608 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc18a1Q8R090 521 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 GraspQ9JJA9 392 aa23.18■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad50P70388 1312 aa23.17■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hps5P59438 1126 aa23.17■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ttc8Q8VD72 515 aa23.17■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lpar1P61793 364 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp11aP98197 1187 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 GlmnQ8BZM1 596 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zcchc14Q8VIG0 956 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ankrd54Q91WK7 299 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srgap1Q91Z69 1062 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 IcoslgQ9JHJ8 322 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmod4Q9JLH8 345 aa23.16■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 E030030I06RikJ3QML9 246 aa23.15■■□□□ 1.3
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Ltb-201ENSMUST00000025262 Ivns1abpQ920Q8 642 aa23.15■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cxcl11Q9JHH5 100 aa23.15■■□□□ 1.3
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il7P10168 154 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Il6stQ00560 917 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ccdc33Q3ULW6 985 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lmod1Q8BVA4 595 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sapcd2Q9D818 391 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 MvpQ9EQK5 861 aa23.14■■□□□ 1.29
Ltb-201ENSMUST00000025262 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
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