RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CsadQ9DBE0 493 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp31E9Q6Y8 1344 aa21.94■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sept2P42208 361 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scfd2Q8BTY8 684 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 OplahQ8K010 1288 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cdca7Q9D0M2 382 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LlphQ9D945 130 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q9D9S1 216 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prg3Q9JL95 222 aa21.93■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mmp10O55123 476 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nmt2O70311 529 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tti2Q8BGV4 512 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ncaph2Q8BSP2 607 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EngaseQ8BX80 734 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tceanc2Q8R2M0 207 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Bcs1lQ9CZP5 418 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EhhadhQ9DBM2 718 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Frmpd4A2AFR3 1320 aa21.92■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Phactr2B1AVP0 632 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ptpn12P35831 775 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gprin1Q3UNH4 932 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Garem2Q6PAJ3 880 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gpr108Q91WD0 569 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pde6aP27664 859 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tacc1Q6Y685 774 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 AnlnQ8K298 1121 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mtmr4Q91XS1 1190 aa21.91■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prr16A3KMN5 304 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rabep1O35551 862 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sema3fO88632 785 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Glra4Q61603 456 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cog5Q8C0L8 829 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Terb1Q8C0V1 768 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pus7lQ8CE46 702 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Paf1Q8K2T8 535 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa21.9■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Col11a1Q61245 1804 aa21.89■■□□□ 1.1
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 HunkO88866 714 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TbcaP48428 108 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stxbp5lQ5DQR4 1185 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rasa3Q60790 834 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myl10Q62082 202 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sv2cQ69ZS6 727 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hps6Q8BLY7 805 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa21.89■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Has3O08650 554 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sec23aQ01405 765 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pxylp1Q8BHA9 480 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Il31raQ8K5B1 716 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ttll1Q91V51 423 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trmt112Q9DCG9 125 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 WtapQ9ER69 396 aa21.88■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 SynrgQ5SV85 1306 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Serpinb2P12388 415 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 PtpraP18052 829 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zbtb39Q6PDK0 712 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1700010I14RikQ7TPG0 532 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Calhm4Q8CE93 315 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Clstn1Q9EPL2 979 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cfap99A0A140LIX9 648 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mtx1P47802 317 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp5P56399 858 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prr7Q3V0I2 269 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pms1Q8K119 917 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ero1bQ8R2E9 467 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eid1Q9DCR4 169 aa21.87■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 TicrrQ8BQ33 1889 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Alppl2P24823 529 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 F2rP30558 430 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pkp1P97350 728 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stk11ipQ3TAA7 1072 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lca5lQ8C0X0 741 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 9230110C19RikQ8CC70 267 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cchcr1Q8K2I2 770 aa21.86■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Stx8O88983 236 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Myl3P09542 204 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 CenpbP27790 599 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Usp50Q6P8X6 390 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Cnksr2Q80YA9 1032 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tmem47Q9JJG6 181 aa21.85■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 VegfbP49766 207 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 EvcP57680 1005 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scg2Q03517 617 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Otud5Q3U2S4 566 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Eme2Q56A04 373 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 LrmpQ60664 539 aa21.84■■□□□ 1.09
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp341Q6PGC9 846 aa21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.1 ms