RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SLX4	Q12098	748 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YRF1-6	P53819	1859 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SEM1	O94742	89 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MPH2	P0CD99	609 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ATR1	P13090	542 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CNA1	P23287	553 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	DAL2	P25335	343 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ADP1	P25371	1049 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RAD14	P28519	371 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	AFG2	P32794	780 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	PEX2	P32800	271 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ATO2	P32907	282 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	LRG1	P35688	1017 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ETR1	P38071	380 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SEA4	P38164	1038 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MRX3	P38172	270 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CST26	P38226	397 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MSR1	P38714	643 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	NDT80	P38830	627 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	FTR1	P40088	404 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YJL107C	P42947	387 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	FAR3	P46671	204 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	PHO86	P46956	311 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	HLJ1	P48353	224 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	NUP84	P52891	726 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ORM1	P53224	222 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YGR125W	P53273	1036 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YIG1	Q08956	461 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	PCL8	Q08966	492 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	GPM3	Q12326	303 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ARP6	Q12509	438 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RIM15	P43565	1770 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	VPS34	P22543	875 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MEF1	P25039	761 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TFC1	P32367	649 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SPR1	P32603	445 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YSC84	P32793	468 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CSG2	P35206	410 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SPC42	P36094	363 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	ARG2	P40360	574 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SNL1	P40548	159 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	FMP32	P43557	207 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SAD1	P43589	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CPR7	P47103	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YJR124C	P47159	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RFX1	P48743	811 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	COG2	P53271	262 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RCF2	P53721	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SRL4	Q03085	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	MUB1	Q03162	620 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TVP15	Q03860	143 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	YET3	Q07451	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	SMC5	Q08204	1093 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	HRT3	Q12347	344 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	GRX6	Q12438	231 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SHH3	YMR118C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84

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