RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 CTR9Q6PD62 1173 aa23.45■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.45■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 EPS15P42566 896 aa23.45■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 NFIAQ12857 509 aa23.45■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.44■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 CLRN2A0PK11 232 aa23.44■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa23.44■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 STX6O43752 255 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 MYO1BO43795 1136 aa23.42■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 CYP2D6P10635 497 aa23.42■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.4■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.4■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.4■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.4■■□□□ 1.34
CLN8-208ENST00000635751 C12orf60Q5U649 245 aa23.4■■□□□ 1.34
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CLN8-208ENST00000635751 SIPA1L1O43166 1804 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 WDR90Q96KV7 1748 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 TTC6Q86TZ1 520 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.35■■□□□ 1.33
CLN8-208ENST00000635751 DYNLL2Q96FJ2 89 aa23.35■■□□□ 1.33
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