RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.86■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB129Q9H1M3 183 aa24.86■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.85■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 RNF20Q5VTR2 975 aa24.85■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 CPA1P15085 419 aa24.84■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.84■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 TTC6Q86TZ1 520 aa24.84■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 EHD4Q9H223 541 aa24.84■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 ADM5C9JUS6 153 aa24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.83■■□□□ 1.57
CSAG3-202ENST00000617158 FAM196BA6NMK8 535 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 TNNI2P48788 182 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 CDK8P49336 464 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K10Q02779 954 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 TNFAIP1Q13829 316 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 TM6SF1Q9BZW5 370 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.82■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 ORC4O43929 436 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 PRDM1O75626 825 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 SHMT1P34896 483 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 CSRNP1Q96S65 589 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.81■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 HLA-DOAP06340 250 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 RASA1P20936 1047 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 ANTXR2P58335 489 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 MYH8P13535 1937 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 B4E1Z4 1266 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 KRT32Q14532 448 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 USP48Q86UV5 1035 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 AMOTL1Q8IY63 956 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 NEK1Q96PY6 1258 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa24.79■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.78■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 TBC1D12O60347 775 aa24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 JAG1P78504 1218 aa24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.77■■□□□ 1.56
CSAG3-202ENST00000617158 KDM4AO75164 1064 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 RPS6KB1P23443 525 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 SULF1Q8IWU6 871 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 NCOA7Q8NI08 942 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 TTC14Q96N46 770 aa24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 PDE4BQ07343 736 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 RUFY3Q7L099 469 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CHST3Q7LGC8 479 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 LDHDQ86WU2 507 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 SWAP70Q9UH65 585 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CLEC11AQ9Y240 323 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.75■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 KIF3CO14782 793 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 PSMA5P28066 241 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CDCA5Q96FF9 252 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 KRT23Q9C075 422 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 FZD1Q9UP38 647 aa24.74■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 AKR1B1P15121 316 aa24.73■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 RABEP1Q15276 862 aa24.73■■□□□ 1.55
CSAG3-202ENST00000617158 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms