RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616504.1

KCNQ1OT1_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene KCNQ1OT1_3, Length 116 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SAMM50Q9Y512 469 aa6.21□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.2□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ASB16Q96NS5 453 aa6.2□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.2□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.2□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FANCGO15287 622 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 INPP5AQ14642 412 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FAM168AQ92567 244 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.19□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 EOMESO95936 686 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 LRRC14Q15048 493 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 NKPD1Q17RQ9 610 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 C12orf49Q9H741 205 aa6.18□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GIPC1O14908 333 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 USP17L7P0C7H9 530 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SPG7Q9UQ90 795 aa6.17□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SLITRK5O94991 958 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 P4HBP07237 508 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ATP2B2Q01814 1243 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 IKZF1Q13422 519 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF124Q15973 351 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ASB11Q8WXH4 323 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FBRSQ9HAH7 460 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa6.16□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 LRIG2O94898 1065 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CDK8P49336 464 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZP2Q05996 745 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SCARA3Q6AZY7 606 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 KCT2Q8NC54 265 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.15□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PRR33A8MZF0 331 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 NKG7Q16617 165 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.14□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CLCN7P51798 805 aa6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 KCNA1Q09470 495 aa6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SV2BQ7L1I2 683 aa6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FOXQ1Q9C009 403 aa6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP6.13□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 HDXQ7Z353 690 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RIN3Q8TB24 985 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 HSPA12BQ96MM6 686 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MIPEPQ99797 713 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 RNF19AQ9NV58 838 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.12□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CDKAL1Q5VV42 579 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa6.11□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 GNA15P30679 374 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 CAP2P40123 477 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 FGD1P98174 961 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 MESP2Q0VG99 397 aa6.1□□□□□ -1.43
KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 SEPT6Q14141 434 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms