RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 TUBB4AP04350 444 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 MYL5Q02045 173 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 VWA3BQ502W6 1294 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CNGA4Q8IV77 575 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SEL1L2Q5TEA6 688 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 TNFAIP3P21580 790 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R7Q15435 360 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SPC25Q9HBM1 224 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 DISP1Q96F81 1524 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SNX16P57768 344 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CNKSR1Q969H4 720 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC114Q96M63 670 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 MYL10Q9BUA6 226 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CALCRLQ16602 461 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 DCAF15Q66K64 600 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CETN3O15182 167 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 KRT9P35527 623 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CAPZA3Q96KX2 299 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 CEP170Q5SW79 1584 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.219e-7■■■■□ 25.7
CTDP1-208ENST00000613122 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 NOX5Q96PH1 765 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 LPXNO60711 386 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 KIF22Q14807 665 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PPARAQ07869 468 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 NLRX1Q86UT6 975 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PLXNC1O60486 1568 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SGSM2O43147 1006 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 KARSQ15046 597 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 LIN9Q5TKA1 542 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CUTAO60888 179 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PBRM1Q86U86 1689 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 RRP9O43818 475 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 MYCT1Q8N699 235 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 MXRA7P84157 204 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM94Q12767 1356 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 DOK7Q18PE1 504 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0232Q92628 1395 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 OPA1O60313 960 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ATP5JP18859 108 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SPOPO43791 374 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP58Q5T655 872 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PHKBQ93100 1093 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 ADGRL2O95490 1459 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 KDRP35968 1356 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 TNNC1P63316 161 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 HACE1Q8IYU2 909 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CALCOCO2Q13137 446 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 GNPTABQ3T906 1256 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SULF1Q8IWU6 871 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 GLG1Q92896 1179 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 GYG1P46976 350 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 DAPK3O43293 454 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 FBF1Q8TES7 1133 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 CSRNP2Q9H175 543 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 SIK1P57059 783 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDP1-208ENST00000613122 NACA2Q9H009 215 aa22.53■■□□□ 1.2
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