RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604740.5

LAMA4-222, Transcript of laminin subunit alpha 4, human

TSL 2

Gene LAMA4, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMA4-222	ENST00000604740	GIPC1	O14908	333 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	FZD5	Q13467	585 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	TNKS2	Q9H2K2	1166 aa		7.23	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	FANCG	O15287	622 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	USP17L7	P0C7H9	530 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	RING1	Q06587	406 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	FAM168A	Q92567	244 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	C12orf49	Q9H741	205 aa		7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
LAMA4-222	ENST00000604740	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	IKZF1	Q13422	519 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	KCT2	Q8NC54	265 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ASB11	Q8WXH4	323 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		7.21	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SPACA3	Q8IXA5	215 aa		7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	JAG1	P78504	1218 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	KCNA1	Q09470	495 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	INPP5A	Q14642	412 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	LRIG2	O94898	1065 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	EOMES	O95936	686 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ZP2	Q05996	745 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FOXQ1	Q9C009	403 aa		7.18	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	CLCN7	P51798	805 aa		7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	HDX	Q7Z353	690 aa		7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FBRS	Q9HAH7	460 aa		7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		7.17	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SLITRK5	O94991	958 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	MIPEP	Q99797	713 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		7.16	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ETF1	P62495	437 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	ZNF124	Q15973	351 aa		7.15	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.15	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7.15	□□□□□ -1.26
LAMA4-222	ENST00000604740	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	LMNB1	P20700	586 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	NKG7	Q16617	165 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	FRMD6	Q96NE9	622 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		7.14	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	PRR33	A8MZF0	331 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	GNA15	P30679	374 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CDK8	P49336	464 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	PKN1	Q16512	942 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	KCNMB1	Q16558	191 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	KSR1	Q8IVT5	923 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	MFSD4A	Q8N468	514 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.13	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	FGD1	P98174	961 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	SEPT6	Q14141	434 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	HID1	Q8IV36	788 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	MFSD2A	Q8NA29	543 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		7.12	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740		H3BS24	57 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	GRK4	P32298	578 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		7.11	□□□□□ -1.27
LAMA4-222	ENST00000604740	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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