RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HPSEQ9Y251 543 aa13.62□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RTL9Q8NET4 1388 aa13.62□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCL9LQ86UU0 1499 aa13.62□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNKSO95271 1327 aa13.62□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PPP6R2O75170 966 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMC2O95347 1197 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MMP1P03956 469 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CAVIN4Q5BKX8 364 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRIM22Q8IYM9 498 aa13.61□□□□□ -0.23
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IFNKQ9P0W0 207 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHD4Q14839 1912 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DOCK2Q92608 1830 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ARAP2Q8WZ64 1704 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHLPP1O60346 1717 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SKILP12757 684 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP1A3P13637 1013 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NLRP12P59046 1061 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WNK3Q9BYP7 1800 aa13.61□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE4AQ14139 1066 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NCAPHQ15003 741 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PTPN21Q16825 1174 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RESP18Q5W5W9 173 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BARGINQ6ZT62 677 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 JMYQ8N9B5 988 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SHISA4Q96DD7 197 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM205CA6NFA0 338 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C8orf37Q96NL8 207 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNH3Q9ULD8 1083 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MYH2Q9UKX2 1941 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NMT2O60551 498 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SEC23AQ15436 765 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ESR2Q92731 530 aa13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STK36Q9NRP7 1315 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP17L12C9JPN9 530 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP17L21D6R901 530 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNNT1P13805 278 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDILTQ8N807 584 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CABP5Q9NP86 173 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 VPS54Q9P1Q0 977 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEXIO95424 95 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRDX5P30044 214 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPS8P62241 208 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 USP49Q70CQ1 688 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNNM3Q8NE01 707 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF592Q92610 1267 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HSD3B7Q9H2F3 369 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.59□□□□□ -0.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCZ1BP86790 482 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMC6Q7Z403 805 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMTC2Q8N394 836 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WASF1Q92558 559 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NGLY1Q96IV0 654 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ECM29Q5VYK3 1845 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GNPATO15228 680 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CUTAO60888 179 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MECOMQ03112 1051 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CTR9Q6PD62 1173 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SETDB2Q96T68 719 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TUBE1Q9UJT0 475 aa13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BMP6P22004 513 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM47AQ5JRC9 791 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRBA2Q6ZNG9 492 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIGD1Q96MW7 591 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRAPQ86VF7 1730 aa13.57□□□□□ -0.24
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
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