RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598934.5

LINC00854-210, Long intergenic non-protein coding RNA 854, human

TSL 5

Gene LINC00854, Length 337 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00854-210	ENST00000598934	HTR3B	O95264	441 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SELP	P16109	830 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	L1CAM	P32004	1257 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GSK3A	P49840	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NCAPH	Q15003	741 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PERM1	Q5SV97	790 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PDZD3	Q86UT5	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SOX13	Q9UN79	622 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GFRA2	O00451	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	RFPL3	O75679	317 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	IGHA1	P01876	353 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ACR	P10323	421 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PTPRA	P18433	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SOX5	P35711	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NEUROD1	Q13562	356 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ADAM19	Q9H013	955 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MCM8	Q9UJA3	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934		H7C1W4	665 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	RAPGEF3	O95398	923 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CPB1	P15086	417 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PML	P29590	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	RHBDL3	P58872	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MLEC	Q14165	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	RNF180	Q86T96	592 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	EXOC2	Q96KP1	924 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	EPN3	Q9H201	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GMIP	Q9P107	970 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PLD2	O14939	933 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	DNAJA2	O60884	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PLCG1	P19174	1290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	ITGA6	P23229	1130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	AP3B2	Q13367	1082 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	IKBKE	Q14164	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	INPP5A	Q14642	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	PCSK7	Q16549	785 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LINC00854-210	ENST00000598934	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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