RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	PTPN18	Q99952	460 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	24.26	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	PALD1	Q9ULE6	856 aa		24.26	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	LAMB1	P07942	1786 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	ERC2	O15083	957 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	24.25	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		24.25	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	24.25	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	MX1	P20591	662 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	UBE3C	Q15386	1083 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	24.24	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		24.24	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	PTPRA	P18433	802 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		24.23	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	GPR25	O00155	361 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	24.22	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	LCORL	Q8N3X6	602 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		24.22	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	CXCL11	O14625	94 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	MBD4	O95243	580 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	SMC5	Q8IY18	1101 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	ARMT1	Q9H993	441 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		24.21	■■□□□ 1.47
PSME3-209	ENST00000589469	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CAP2	P40123	477 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CRHR2	Q13324	411 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	TTC6	Q86TZ1	520 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	DNAJC18	Q9H819	358 aa		24.2	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	BTBD19	C9JJ37	291 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	IGHD	P01880	384 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CHGB	P05060	677 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	EHD4	Q9H223	541 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		24.19	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	FKTN	O75072	461 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	24.18	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	LNPK	Q9C0E8	428 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	STAP2	Q9UGK3	403 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	DOCK1	Q14185	1865 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	SIPA1L1	O43166	1804 aa		24.17	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	DGKZ	Q13574	1117 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	24.16	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM75P	A6NK02	468 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	PRKAB2	O43741	272 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ASNS	P08243	561 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	PDE1A	P54750	535 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	MOGS	Q13724	837 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	APPBP2	Q92624	585 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	FSD1	Q9BTV5	496 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	GINM1	Q9NU53	330 aa		24.15	■■□□□ 1.46
PSME3-209	ENST00000589469	USP17L5	A8MUK1	530 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	PLCD1	P51178	756 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		24.14	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	24.13	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	PDHX	O00330	501 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	GDF11	O95390	407 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	NUCB1	Q02818	461 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		24.13	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	SPP2	Q13103	211 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		24.12	■■□□□ 1.45
PSME3-209	ENST00000589469	OSBP2	Q969R2	916 aa		24.12	■■□□□ 1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms