RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 PBX4Q9BYU1 374 aa9.8□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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GGA3-218ENST00000584243 SPTBN2O15020 2390 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 GOLGA6L22H0YM25 854 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 PDHXO00330 501 aa9.79□□□□□ -0.84
GGA3-218ENST00000584243 MCM2P49736 904 aa9.79□□□□□ -0.84
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GGA3-218ENST00000584243 ZBTB3Q9H5J0 574 aa9.78□□□□□ -0.84
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GGA3-218ENST00000584243 SKAP1Q86WV1 359 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 KIAA0825Q8IV33 1275 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 TRIB2Q92519 343 aa9.75□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 PDLIM7Q9NR12 457 aa9.75□□□□□ -0.85
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GGA3-218ENST00000584243 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
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GGA3-218ENST00000584243 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 BCL11AQ9H165 835 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 COG5Q9UP83 839 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 CACNA1FO60840 1977 aa9.74□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 DCXO43602 365 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 FLIIQ13045 1269 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 PPIL2Q13356 520 aa9.73□□□□□ -0.85
GGA3-218ENST00000584243 GPAT2Q6NUI2 795 aa9.73□□□□□ -0.85
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