RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581080.1

RARA-AS1-201, RARA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RARA-AS1, Length 1,790 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARA-AS1-201ENST00000581080 ESR2Q92731 530 aa27.6■■■□□ 2.01
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RARA-AS1-201ENST00000581080 SHTN1A0MZ66 631 aa27.59■■■□□ 2.01
RARA-AS1-201ENST00000581080 TTC6Q86TZ1 520 aa27.59■■■□□ 2.01
RARA-AS1-201ENST00000581080 BRF1Q92994 677 aa27.59■■■□□ 2.01
RARA-AS1-201ENST00000581080 TPCN1Q9ULQ1 816 aa27.59■■■□□ 2.01
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
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RARA-AS1-201ENST00000581080 SPDYE2Q495Y8 402 aa27.57■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.55■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 FKBP1CQ5VVH2 108 aa27.53■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 EGFRP00533 1210 aa27.53■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 H7C1D1 291 aa27.52■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.51■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 UBAC1Q9BSL1 405 aa27.51■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 EHD4Q9H223 541 aa27.51■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 FOXD4L1Q9NU39 408 aa27.51■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 FAM151AQ8WW52 585 aa27.49■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 SWAP70Q9UH65 585 aa27.49■■□□□ 1.99
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RARA-AS1-201ENST00000581080 NECAB1Q8N987 351 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 BRPF3Q9ULD4 1205 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 TNKSO95271 1327 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 ST3GAL1Q11201 340 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 TMTC2Q8N394 836 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 SENP2Q9HC62 589 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.48■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 CNTNAP1P78357 1384 aa27.47■■□□□ 1.99
RARA-AS1-201ENST00000581080 STK3Q13188 491 aa27.47■■□□□ 1.99
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